小满午夜，刘镇南带领村民夜袭百草谷营地。在营地深处，他们发现了正在炼制控灵蛊的毒鼎。鼎中翻滚的绿色液体里，浸泡着无数草木精灵的残魂。

正当众人欲毁鼎时，百草谷长老突然现身。他祭出本命法宝万毒幡，幡中飞出万千毒虫。危急时刻，林素衣残魂融入古槐树，树木突然活了过来，枝条化作长鞭抽向毒幡。

芒种黎明，一场恶战在晨雾中展开。古槐树与万毒幡斗得难分难解，刘镇南则带领村民破坏控灵蛊的炼制。当第一缕阳光照进营地时，控灵蛊终于被彻底净化。

但更大的危机接踵而至。夏至那日，整片百草园突然枯萎，所有灵植在一夜之间失去生机。地底传来令人心悸的波动，仿佛有什么可怕的存在正在苏醒。

大暑三更，刘镇南冒险深入地下。在千丈深处，他发现了令人震惊的真相——整座青牛村竟然建立在一株万年树妖的躯干之上。而百草谷的目的，就是要唤醒这株沉睡的树妖。

立秋薄暮，万年树妖终于苏醒。它的根须破土而出，如巨蟒般缠绕村庄。更可怕的是，树妖能够操控所有草木，整片山脉的植物都成了它的爪牙。

危急关头，刘镇南想起《草木真解》最后的记载：唯有以木灵之心为引，方能安抚万年树妖。而木灵之心，正是林素衣残魂所化的那枚灵种。

寒露子时，当树妖的根须即将摧毁祠堂时，刘镇南毅然取出灵种。在月光照耀下，灵种发出温润的绿光，树妖的暴动渐渐平息。但林素衣的残魂，也因此彻底消散。

霜降拂晓，当第一片树叶落下时，刘镇南发现自己获得了与万年树妖沟通的能力。更神奇的是，通过树妖的根系，他能够感知到百里外的一草一木。

然而福兮祸所伏，这种能力引来了更可怕的觊觎者。立冬那日，天外飞来一道绿芒，一个自称青帝传人的神秘修士降临村庄。他手持青木令，声称要收回万年树妖的控制权。