恺撒的主要目标是确保能够获得第二任执政官职位——这一提议早在公元前52年就已提出,作为与庞培的独任执政官职并行的职位——并获得凯旋。
他担心当时掌握公元前50年执政官职的对手会拒绝他的候选资格,或拒绝批准他当选。
这也正是他发动战争的核心理由:他认为庞培及其盟友计划通过武力(这一点在驱逐支持者的举动中有所体现)压制罗马人民的自由,阻止他们选举恺撒并表彰他的成就。
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公元前49年1月10日或11日左右,作为对元老院“最终决议”的回应,恺撒带领一支由第十三军团(Legio XIII Gemina)组成的军队越过了卢比孔河,这条河流是意大利北部的界限,从而引发了内战。
据普鲁塔克(Plutarch)和苏埃托尼乌斯(Suetonius)所述,恺撒在越过卢比孔河时,据说引用了希腊剧作家美南德(Menander)的话:“骰子已经掷下”(Alea iacta est)。
庞培和许多元老逃往南方,认为恺撒正在迅速进军罗马。
恺撒在控制了通往罗马的交通路线后,暂停了行动并展开了谈判,但由于互相的不信任,谈判破裂。
恺撒随后决定继续南进,试图捕捉庞培,迫使召开会议。
庞培撤退到布伦迪修姆(Brundisium),并成功逃往希腊,面对恺撒更强大的军队,他放弃了意大利并成功避开了恺撒的追击。
恺撒在罗马附近停留了大约两周——在此期间,他强行接管了财政,并违背了部族法官的否决权,这也让他所谓的为部族法官辩护的战争理由不攻自破——随后他将意大利交给了莱皮杜斯(Lepidus)管理,而他则出征庞培的西属省份。
他在伊勒尔达战役(Battle of Ilerda)中击败了庞培的两名副官,并迫使第三名副官投降。
之后,恺撒的副官进军西西里岛和非洲,但非洲远征以失败告终。
秋季时,恺撒返回罗马,指派莱皮杜斯担任执政官,依据一项法律任命恺撒为独裁官,以组织选举。
他与普布利乌斯·塞尔维利乌斯·伊萨乌里库斯(Publius Servilius Isauricus)一起赢得了随后一年的选举,将在公元前48年共同担任执政官。
恺撒在担任独裁官仅11天后辞去职务,随后他离开意大利前往希腊,阻止庞培的备战,并于公元前48年初以强大兵力到达。
恺撒围困了庞培在迪尔哈基乌姆(Dyrrhachium)的兵营,但庞培成功突围,迫使恺撒的军队撤退。
恺撒追随庞培,进入希腊东南部,并为了救回一名副官,与庞培在公元前48年8月9日的法萨卢斯战役(Pharsalus)中展开决战,并最终彻底击败庞培。