皇后病情愈发沉重，知道自己将不久于人世，便叫来太宗与他诀别。

当时恰好房玄龄因事被太宗免官，皇后躺在榻上，拉着太宗的手不舍的说：“玄龄跟随陛下很久，为人小心谨慎，做事也很周详，参与筹划的机密大事从来不曾泄露。如他没有犯下其他大的过失，希望陛下能重新启用。”太宗含泪点头。

皇后接着说：“妾的宗族因沾亲带故得以享有朝廷俸禄，如果没有德行做保证，容易犯错覆亡。陛下若想为了我而保全他们的后代子孙，那就请别把他们放到重要岗位，只须让他们有个外戚身份，能入朝参谒就可以了。”

“妾活着无利于人，死后也不可麻烦他人，千万不要劳烦天下为我筑陵，只须借山为坟，瓦木陪葬。”

“妾愿陛下亲近君子、疏远小人，广纳忠臣建议、屏蔽奸佞谗言，减少劳役、停止游猎，妾在九泉之下也能了无遗憾。”

太宗见她气喘不止，忙一边轻抚，一边示意身边侍女去传唤子女前来。皇后制止说：“不要叫他们来，看到他们悲哀，只会平添心乱。”

说完这句话，皇后吃力的从衣带中取出一直深藏的那包毒药，深情看着太宗说：“当初陛下病重，妾曾发誓以死相随，不能让自己成为吕后那样的人。”

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所谓大丈夫有泪不轻弹，只是未到伤心时。眼见妻子在生命垂危之际，记挂最多的还是江山社稷，太宗的眼泪控制不住的夺眶而出。

六月二十一日，皇后病故，生命永远定格在三十六岁。

皇后曾收集整理古往今来的妇女得失，编撰了《女则》三十卷。死后，官吏将此书呈献太宗。太宗睹物思人泪湿衣襟，哽咽着对身旁近臣说：“皇后这本书足以垂范百世，朕不是不知道天命如此，伤悲徒劳无用。但只要一想起从今往后再也听不到她的良言规劝，失去了人生最好伴侣，就止不住的伤心难过！”

十一月，太宗按长孙皇后遗愿，将她埋葬在九嵕山昭陵（九嵕山也叫九崚山，位陕西咸阳礼泉县），谥号“文德”。

古人死后谥号通常用单字表述，只有当单字无法完整表达逝者的美行时，才会用上两个字，因此两个字的谥号极为罕见。从太宗给妻子的谥号中，足以看出太宗对皇后的敬重与追念。

太宗亲自撰文刻写于石碑，文中写道：“皇后节俭，遗言薄葬，认为‘盗贼只贪求珍宝，若墓中无宝，他们盗之何用。’朕的意思也是如此。帝王以天下为家，何必在死后非要把宝物放在墓中。这次修筑昭陵工人不过百人，数十天完工，墓中器皿全用土木做成，定可使盗贼息心，生者与死者都无须负累，这种做法应让后代子孙仿效。”

皇后病逝近半年，太宗让人在宫苑中修筑高台，以便能登高远望昭陵，聊抚思念之苦。一次太宗带着魏徵登上高台，告诉他昭陵的方向。魏徵眯眼看了许久，对太宗说：“臣眼神不济，看不清楚。”太宗指给他看，魏徵说：“臣以为陛下您在眺望埋葬高祖的献陵，若是昭陵臣能看到。”

太宗知道魏徵是在通过这种方式劝谏自己，大哭一场后，忍痛让人把高台拆毁。