这一时期创作上的重点放在系列美术片上，比如《葫芦兄弟》，《邋遢大王奇遇记》，《舒克和贝塔》，《魔方大厦》等一系列经典作品。

可惜的是，作为国企，魔都美术电影厂还是适应不了飞速变化新市场和新环境，陷入困境...

1995年左右，美国和日本动漫产品已经悄然登陆内地，迪士尼的《狮子王》和《玩具总动员》席卷全国...

经历了市场化转型，人才流失，外部冲击等困境而沉寂了十二年的魔都美术电影厂孤注一掷，把所有资源和资金投入到动画电影《宝莲灯》中，这也是国内第一部尝试商业化运作的动画电影。

300位工作人员，绘制了15万张动画画面，2000幅背景，拍摄1800个镜头，前后耗时4年，《宝莲灯》终于拍摄完成。

有不少明星名人都参与了这部动画电影的配音，有年仅14岁就已经是魔都电视台的御用小主持的胡哥，配音二郎神的江文，配音孙悟空的陈佩斯，配音梅山兄弟的朱时茂，配音三圣母的徐帆，配音嘎妹的宁静...

1999年，《宝莲灯》正式上映，当时的电影票不过5元一张，最终还是揽下2400万票房，位居冯晓刚的《不见不散》之后成为票房亚军，要知道，这一年，迪士尼的《花木兰》在国内的票房也不过1000万。

可惜的是，这部动画电影的成本1200万，当时制片方只有不到四成的票房分账，商业上来说，《宝莲灯》失败了，是一笔亏本买卖。

口碑上，它在当时也同样失败：

《无锡日报》指出沉香是个“扁型人物”，对其人物性格的塑造都流于表面，情节设计上也没有注重细节...

《南方都市报》尖刻地指出其人物造型老土，号称投入1200万的大制作，却难以达到精细的效果...

《四川新闻网》直言这是“简单地照搬好莱坞模式的失败”...